Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bbof1Q3V079 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bbof1Q3V079 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bbof1Q3V079 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bbof1Q3V079 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms