Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxred2Q3USW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxred2Q3USW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxred2Q3USW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxred2Q3USW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms