Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3UPC7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3UPC7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UPC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UPC7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q3UPC7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q3UPC7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3UPC7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q3UPC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q3UPC7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3UPC7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3UPC7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q3UPC7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UPC7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3UPC7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UPC7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UPC7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UPC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UPC7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms