Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smcr8Q3UMB5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smcr8Q3UMB5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smcr8Q3UMB5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smcr8Q3UMB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smcr8Q3UMB5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smcr8Q3UMB5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smcr8Q3UMB5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms