Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc2Q3ULD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mccc2Q3ULD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.1 ms