Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ceacam5Q3UKK2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ceacam5Q3UKK2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ceacam5Q3UKK2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ceacam5Q3UKK2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms