Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnd1Q3UH93 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxnd1Q3UH93 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxnd1Q3UH93 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Plxnd1Q3UH93 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxnd1Q3UH93 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxnd1Q3UH93 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxnd1Q3UH93 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms