Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
D17Wsu92eQ3TT38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D17Wsu92eQ3TT38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D17Wsu92eQ3TT38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms