Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Echdc2Q3TLP5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Echdc2Q3TLP5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Echdc2Q3TLP5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Echdc2Q3TLP5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Echdc2Q3TLP5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Echdc2Q3TLP5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Echdc2Q3TLP5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Echdc2Q3TLP5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Echdc2Q3TLP5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms