Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrx1Q3TL44 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrx1Q3TL44 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlrx1Q3TL44 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrx1Q3TL44 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms