Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47cQ14BE7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47cQ14BE7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47cQ14BE7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47cQ14BE7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47cQ14BE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam47cQ14BE7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam47cQ14BE7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam47cQ14BE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam47cQ14BE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam47cQ14BE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam47cQ14BE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms