Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG62

Uncharacterized protein C8orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VG62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q0VG62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q0VG62 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q0VG62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q0VG62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q0VG62 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q0VG62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q0VG62 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q0VG62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q0VG62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q0VG62 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q0VG62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q0VG62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q0VG62 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q0VG62 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q0VG62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q0VG62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q0VG62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q0VG62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q0VG62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q0VG62 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q0VG62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q0VG62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q0VG62 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q0VG62 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q0VG62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q0VG62 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q0VG62 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q0VG62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q0VG62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q0VG62 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q0VG62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q0VG62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q0VG62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q0VG62 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q0VG62 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q0VG62 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Q0VG62 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q0VG62 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q0VG62 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q0VG62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q0VG62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q0VG62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q0VG62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q0VG62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q0VG62 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q0VG62 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q0VG62 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q0VG62 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q0VG62 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q0VG62 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q0VG62 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q0VG62 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q0VG62 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q0VG62 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q0VG62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q0VG62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q0VG62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q0VG62 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q0VG62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q0VG62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q0VG62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q0VG62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q0VG62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q0VG62 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Q0VG62 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q0VG62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q0VG62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q0VG62 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q0VG62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q0VG62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q0VG62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q0VG62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q0VG62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q0VG62 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q0VG62 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q0VG62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q0VG62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms