Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b3Q0VF55 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp2b3Q0VF55 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b3Q0VF55 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b3Q0VF55 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms