Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc138Q0VF22 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc138Q0VF22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms