Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmbpQ07456 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmbpQ07456 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmbpQ07456 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmbpQ07456 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmbpQ07456 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmbpQ07456 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmbpQ07456 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AmbpQ07456 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AmbpQ07456 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms