Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snai1Q02085 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snai1Q02085 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snai1Q02085 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snai1Q02085 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snai1Q02085 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms