Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SeleQ00690 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeleQ00690 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SeleQ00690 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SeleQ00690 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeleQ00690 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeleQ00690 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeleQ00690 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms