Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Thumpd3P97770 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thumpd3P97770 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd3P97770 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms