Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CiitaP79621 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CiitaP79621 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CiitaP79621 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CiitaP79621 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CiitaP79621 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CiitaP79621 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CiitaP79621 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CiitaP79621 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CiitaP79621 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CiitaP79621 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CiitaP79621 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CiitaP79621 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CiitaP79621 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms