Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tlr8P58682 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlr8P58682 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tlr8P58682 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tlr8P58682 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms