Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 YOR343CYOR343C 327 nt7.09□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 SRF1YDL133W 1314 nt7.08□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.08□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 BUD20YLR074C 501 nt7.08□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 YLR122CYLR122C 378 nt7.08□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 ECM30YLR436C 3825 nt7.08□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 YPR127WYPR127W 1038 nt7.08□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 SEC23YPR181C 2307 nt7.08□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 RSC2YLR357W 2670 nt7.07□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 MPE1YKL059C 1326 nt7.07□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 ERG27YLR100W 1044 nt7.07□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 NUP84YDL116W 2181 nt7.07□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 IRC5YFR038W 2562 nt7.07□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 DLD1YDL174C 1764 nt7.06□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 GUF1YLR289W 1938 nt7.06□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 DML1YMR211W 1428 nt7.06□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 HXT17YNR072W 1695 nt7.06□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 YPQ2YDR352W 954 nt7.05□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 TRR1YDR353W 960 nt7.05□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 URH1YDR400W 1023 nt7.05□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 TRR2YHR106W 1029 nt7.05□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 ARC35YNR035C 1029 nt7.05□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 KDX1YKL161C 1302 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 MHP1YJL042W 4197 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 HHY1YEL059W 309 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 PAC10YGR078C 600 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 CDC11YJR076C 1248 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 MIX17YMR002W 471 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 YNL017CYNL017C 339 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 PHO85YPL031C 918 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 EFM1YHL039W 1758 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 CHS5YLR330W 2016 nt7.04□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 ARA2YMR041C 1008 nt7.03□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 REG2YBR050C 1017 nt7.03□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 IRS4YKR019C 1848 nt7.03□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 BRN1YBL097W 2265 nt7.03□□□□□ -1.28
YNL058CP53947 HPT1YDR399W 666 nt7.02□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 MRPL28YDR462W 444 nt7.02□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 MEU1YLR017W 1014 nt7.02□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 NFS1YCL017C 1494 nt7.02□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 AMN1YBR158W 1650 nt7.02□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 CEM1YER061C 1329 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 MSS1YMR023C 1581 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 YCR049CYCR049C 447 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 ERS1YCR075C 783 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 DMC1YER179W 1005 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 ATP23YNR020C 813 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 TDP1YBR223C 1635 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 CTA1YDR256C 1548 nt7.01□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 YBR284WYBR284W 2394 nt7□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 AI5_BETAQ0075 1065 nt7□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 RRP46YGR095C 672 nt7□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 KIN1YDR122W 3195 nt7□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 KNS1YLL019C 2214 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 LDB19YOR322C 2457 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 FAF1YIL019W 1041 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 PUS5YLR165C 765 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 YOL099CYOL099C 492 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 GET4YOR164C 939 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 MCH2YKL221W 1422 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 HIS7YBR248C 1659 nt6.99□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 CYB2YML054C 1776 nt6.98□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 RQC1YDR333C 2172 nt6.98□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 PRS4YBL068W 981 nt6.98□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 TUF1YOR187W 1314 nt6.98□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 YBR241CYBR241C 1467 nt6.98□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 YFL052WYFL052W 1398 nt6.97□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 RSP5YER125W 2430 nt6.97□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.97□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.97□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.97□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.97□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 GDA1YEL042W 1557 nt6.96□□□□□ -1.29
YNL058CP53947 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.96□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 YPR130CYPR130C 408 nt6.96□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 SPS22YCL048W 1392 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 TRP5YGL026C 2124 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 RPL2BYIL018W 765 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 YML079WYML079W 606 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 RTC4YNL254C 1206 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 PLB2YMR006C 2121 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 MSN2YMR037C 2115 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 CMR1YDL156W 1569 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 YPL247CYPL247C 1572 nt6.95□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 CIA1YDR267C 993 nt6.94□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 SKY1YMR216C 2229 nt6.94□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 MSG5YNL053W 1470 nt6.93□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 TKL2YBR117C 2046 nt6.93□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 BNS1YGR230W 414 nt6.92□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 YPL067CYPL067C 597 nt6.92□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 PAP2YOL115W 1755 nt6.92□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 YAL045CYAL045C 309 nt6.91□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 REC114YMR133W 1287 nt6.91□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 YNL165WYNL165W 1221 nt6.91□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 PRY3YJL078C 2646 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 GPH1YPR160W 2709 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 TOM20YGR082W 552 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 PIH1YHR034C 1035 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 PTC7YHR076W 1032 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 NTG1YAL015C 1200 nt6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms