Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Map3k1P53349 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Map3k1P53349 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Map3k1P53349 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Map3k1P53349 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Map3k1P53349 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Map3k1P53349 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms