Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnd1P30999 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnd1P30999 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctnnd1P30999 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms