Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrcc6P23475 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc6P23475 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc6P23475 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrcc6P23475 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms