Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpraP18052 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpraP18052 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpraP18052 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpraP18052 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpraP18052 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpraP18052 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpraP18052 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpraP18052 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpraP18052 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpraP18052 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtpraP18052 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpraP18052 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpraP18052 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtpraP18052 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtpraP18052 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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