Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col1a1P11087 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col1a1P11087 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col1a1P11087 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col1a1P11087 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col1a1P11087 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a1P11087 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a1P11087 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a1P11087 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms