Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CatspereP0DP43 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CatspereP0DP43 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CatspereP0DP43 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CatspereP0DP43 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms