Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtrP07309 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtrP07309 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtrP07309 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtrP07309 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TtrP07309 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtrP07309 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtrP07309 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtrP07309 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtrP07309 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtrP07309 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtrP07309 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtrP07309 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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TtrP07309 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtrP07309 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtrP07309 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtrP07309 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtrP07309 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtrP07309 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtrP07309 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TtrP07309 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TtrP07309 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TtrP07309 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TtrP07309 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TtrP07309 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TtrP07309 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TtrP07309 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TtrP07309 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TtrP07309 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TtrP07309 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TtrP07309 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TtrP07309 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TtrP07309 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TtrP07309 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TtrP07309 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TtrP07309 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtrP07309 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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