Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csn3P06796 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csn3P06796 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csn3P06796 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csn3P06796 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn3P06796 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn3P06796 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn3P06796 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms