Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Odc1P00860 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Odc1P00860 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odc1P00860 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odc1P00860 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odc1P00860 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odc1P00860 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odc1P00860 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odc1P00860 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odc1P00860 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odc1P00860 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odc1P00860 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Odc1P00860 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms