Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dnmt3aO88508 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnmt3aO88508 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3aO88508 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms