Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srpk1O70551 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk1O70551 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms