Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cer1O55233 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cer1O55233 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cer1O55233 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cer1O55233 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cer1O55233 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cer1O55233 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cer1O55233 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cer1O55233 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cer1O55233 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cer1O55233 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cer1O55233 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cer1O55233 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cer1O55233 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cer1O55233 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cer1O55233 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cer1O55233 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cer1O55233 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cer1O55233 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cer1O55233 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms