Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TsksO54887 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TsksO54887 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TsksO54887 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TsksO54887 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TsksO54887 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TsksO54887 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TsksO54887 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TsksO54887 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TsksO54887 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TsksO54887 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TsksO54887 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TsksO54887 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TsksO54887 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TsksO54887 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TsksO54887 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TsksO54887 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TsksO54887 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TsksO54887 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TsksO54887 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TsksO54887 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TsksO54887 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TsksO54887 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TsksO54887 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TsksO54887 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TsksO54887 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TsksO54887 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TsksO54887 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TsksO54887 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TsksO54887 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TsksO54887 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TsksO54887 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TsksO54887 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TsksO54887 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TsksO54887 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TsksO54887 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TsksO54887 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TsksO54887 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TsksO54887 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TsksO54887 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TsksO54887 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TsksO54887 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TsksO54887 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TsksO54887 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TsksO54887 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TsksO54887 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TsksO54887 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TsksO54887 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TsksO54887 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TsksO54887 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TsksO54887 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TsksO54887 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TsksO54887 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TsksO54887 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TsksO54887 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TsksO54887 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TsksO54887 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TsksO54887 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TsksO54887 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TsksO54887 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TsksO54887 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TsksO54887 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TsksO54887 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TsksO54887 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TsksO54887 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TsksO54887 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TsksO54887 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TsksO54887 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TsksO54887 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TsksO54887 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TsksO54887 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TsksO54887 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TsksO54887 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TsksO54887 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TsksO54887 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TsksO54887 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TsksO54887 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TsksO54887 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TsksO54887 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TsksO54887 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TsksO54887 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TsksO54887 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TsksO54887 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TsksO54887 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TsksO54887 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TsksO54887 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TsksO54887 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TsksO54887 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TsksO54887 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TsksO54887 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TsksO54887 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TsksO54887 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TsksO54887 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TsksO54887 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TsksO54887 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TsksO54887 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TsksO54887 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TsksO54887 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TsksO54887 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TsksO54887 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms