Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnxbO35452 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TnxbO35452 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TnxbO35452 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TnxbO35452 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TnxbO35452 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TnxbO35452 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TnxbO35452 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TnxbO35452 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms