Protein–RNA interactions for Protein: O35083

Agpat1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agpat1O35083 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Agpat1O35083 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Agpat1O35083 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Agpat1O35083 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Agpat1O35083 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Agpat1O35083 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Agpat1O35083 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms