Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyth3O08967 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyth3O08967 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth3O08967 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms