Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34c3J3QJW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c3J3QJW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms