Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

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Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b1G5E829 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b1G5E829 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b1G5E829 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms