Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NpcdF8VQB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NpcdF8VQB8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NpcdF8VQB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NpcdF8VQB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms