Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Speer4aF8VPX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4aF8VPX6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4aF8VPX6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Speer4aF8VPX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms