Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcdc2bF7BCK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcdc2bF7BCK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcdc2bF7BCK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcdc2bF7BCK0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dcdc2bF7BCK0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Dcdc2bF7BCK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dcdc2bF7BCK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcdc2bF7BCK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcdc2bF7BCK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcdc2bF7BCK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcdc2bF7BCK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcdc2bF7BCK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcdc2bF7BCK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcdc2bF7BCK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms