Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc7bE9Q9Y3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms