Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5M4

Zfr2, Zinc finger RNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfr2E9Q5M4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfr2E9Q5M4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfr2E9Q5M4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfr2E9Q5M4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfr2E9Q5M4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfr2E9Q5M4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfr2E9Q5M4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms