Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r56E9Q4U5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r56E9Q4U5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Vmn2r56E9Q4U5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn2r56E9Q4U5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r56E9Q4U5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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