Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r68E9Q0V3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r68E9Q0V3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r68E9Q0V3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r68E9Q0V3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms