Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Trappc8E9PWG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Trappc8E9PWG2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Trappc8E9PWG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trappc8E9PWG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trappc8E9PWG2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Trappc8E9PWG2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 543.5 ms