Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna7C0LLJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kpna7C0LLJ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kpna7C0LLJ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna7C0LLJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kpna7C0LLJ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kpna7C0LLJ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna7C0LLJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna7C0LLJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms