Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clrn2B2RVW2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clrn2B2RVW2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clrn2B2RVW2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clrn2B2RVW2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms