Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arhgap42B2RQE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgap42B2RQE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap42B2RQE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms